CHKBiotech успешно разработал набор для обнаружения новых вариантов коронавируса

Новый штамм 501Y-V2 варианта коронавируса из Южной Африки
18 декабря 2020 года в ЮАР был обнаружен мутант нового коронавируса 501Y-V2. Сейчас южноафриканский мутант распространился более чем в 20 странах. Эксперименты показали, что указанные выше мутанты нового коронавируса могут нести другие варианты мутаций нового коронавируса K417N / T, E484K и N501Y, которые могут снижать нейтрализующую способность индуцированных вакциной нейтрализующих антител в плазме. Однако по сравнению с эталонным геномом Wuh01 (порядковый номер MN908947), последовательность 501Y.V2 южноафриканской мутантной геномной последовательности имеет 23 варианта нуклеотидов. Он имеет ту же мутацию N501Y, что и британский мутантный подтип B.1.1.7, но все еще содержит мутации в двух ключевых сайтах E484K и K417N белка S, которые потенциально могут влиять на способность вируса инфицировать.

Новый коронавирус - это вирус с одноцепочечной РНК, в геноме которого чаще встречаются мутации. Обнаружение одной цели может легко привести к пропущенному обнаружению образцов с низкой вирусной нагрузкой и мутировавших штаммов вирусов. Частота повторного обследования при единичном положительном результате при обнаружении цели может достигать более 10%, что может увеличить рабочую нагрузку и продлить время диагностики. Обнаружение нескольких целей и взаимная проверка результатов каждой цели могут повысить скорость обнаружения и облегчить раннюю диагностику.

news1

Рисунок 1. Принципиальная схема механизма заражения новым коронавирусом.

Новый мутант коронавируса B.1.1.7 из Великобритании
26 декабря 2020 года в Интернете была опубликована первая научная статья о штамме B.1.1.7. Институт гигиены Лондонского университета и тропических болезней подтвердил, что штамм B.1.1.7 более способен к распространению, чем другие штаммы, что составило более 56% (95% ДИ 50-74%). Поскольку этот новый мутантный штамм обладает более очевидной способностью к передаче, стало труднее контролировать COVID-19. На следующий день Бирмингемский университет в Соединенном Королевстве загрузил статью о MedRxiv. Исследование показало, что количество копий генов вируса ORF1ab и N у пациентов, инфицированных мутантным штаммом B.1.1.7 (выпадение S-гена), было значительно увеличено; это явление отслеживалось у населения. В этой статье указывается, что пациенты, инфицированные мутантом B.1.1.7 из Великобритании, имеют значительно более высокую вирусную нагрузку, поэтому этот мутант также может быть более патогенным.

1

Рисунок 2. Последовательность мутации генома, содержащаяся в мутантном штамме коронавируса B.1.1.7 из Великобритании.

2

Рисунок 3. Мутация N501Y произошла как в Великобритании, так и в Южной Африке. Варианты

Комплект для обнаружения новых вариантов коронавируса
Компания Chuangkun Biotech Inc. успешно разработала набор для обнаружения новых вариантов коронавируса B.1.1.7 и 501Y-V2.

Преимущества этого продукта: высокая чувствительность , одновременное обнаружение 4 мишеней, охватывающих основные сайты мутаций мутантного штамма B.1.1.7 и южноафриканского мутантного штамма 501Y.V2. Этот набор может одновременно обнаруживать сайты мутаций N501Y, HV69-70del, E484K и новый ген S коронавируса; Быстрый тест: требуется всего 1 час 30 минут с момента взятия образца до получения результата.

3

Рис. 4. Кривая усиления варианта развития COVID-19 в Великобритании.

4

Рисунок 5. Обнаружение южноафриканской кривой усиления варианта COVID-19

5

Рис. 6. Кривая амплификации нового коронавируса дикого типа.

Неясно, как эти мутации накапливают новое долгосрочное влияние пандемии COVID-19. Но это напоминает нам, что эти мутации могут повлиять на эффективность естественного иммунитета и иммунитета, вызванного вакцинацией. Это также напоминает нам о том, что нам необходимо постоянно следить за новым коронавирусом в течение длительного времени и обновлять вакцину COVID-19, чтобы справиться с эволюцией нового коронавируса.


Время публикации: март-12-2021