CHKBiotech успешно разработала набор для обнаружения новых вариантов коронавируса

Новый вариант коронавируса 501Y-V2 из Южной Африки
18 декабря 2020 года в Южной Африке был обнаружен мутант 501Y-V2 нового коронавируса.Сейчас южноафриканский мутант распространился более чем в 20 странах.Эксперименты показали, что вышеуказанные мутанты нового коронавируса могут нести другие варианты нового коронавируса: мутации K417N/T, E484K и N501Y, которые могут снижать нейтрализующую способность нейтрализующих антител, индуцированных вакциной, в плазме.Однако по сравнению с эталонным геномом Wuh01 (порядковый номер MN908947), последовательность 501Y.V2 южноафриканского мутантного генома имеет 23 нуклеотидных варианта.Он имеет ту же мутацию N501Y, что и британский мутант подтипа B.1.1.7, но все еще содержит мутации в двух ключевых сайтах E484K и K417N белка S, которые оказывают потенциально важное влияние на способность вируса инфицировать.

Новый коронавирус представляет собой одноцепочечный РНК-вирус, мутации в геноме которого встречаются чаще.Обнаружение одной цели может легко привести к пропущенному обнаружению образцов с низкой вирусной нагрузкой и мутировавшими штаммами вируса.Частота повторных обследований при единичном положительном результате целевого обнаружения может достигать более 10%, что может увеличить рабочую нагрузку и продлить время диагностики.Обнаружение нескольких целей и взаимная проверка результатов каждой цели могут повысить уровень обнаружения и облегчить раннюю диагностику.

новости1

Рисунок 1. Принципиальная схема механизма заражения новым коронавирусом.

Новый мутант коронавируса B.1.1.7 из Британии
26 декабря 2020 г. в Интернете была опубликована первая научная статья о штамме B.1.1.7.Институт гигиены Лондонского университета и тропических болезней Великобритании подтвердил, что штамм B.1.1.7 более способен к распространению, чем другие штаммы, что составило более 56% (95% ДИ 50-74%).Поскольку этот новый мутантный штамм обладает более очевидной способностью передачи, контролировать COVID-19 стало сложнее.На следующий день Бирмингемский университет в Великобритании опубликовал статью на MedRxiv.Исследование показало, что количество копий генов вируса ORF1ab и N у пациентов, инфицированных мутантным штаммом B.1.1.7 (выпадение S-гена), было значительно увеличено;это явление наблюдалось среди населения.В этой статье указывается, что пациенты, инфицированные мутантом B.1.1.7 Британии, имеют значительно более высокую вирусную нагрузку, поэтому этот мутант также может быть более патогенным.

1

Рисунок 2. Последовательность геномной мутации, содержащаяся в мутантном штамме коронавируса B.1.1.7 из Великобритании.

2

Рисунок 3. Мутация N501Y произошла как в Великобритании, так и в Южной Африке.Варианты

Набор для обнаружения новых вариантов коронавируса
Компания Chuangkun Biotech Inc. успешно разработала набор для обнаружения новых вариантов коронавируса B.1.1.7 и 501Y-V2.

Преимущества продукта: высокая чувствительность, одновременное обнаружение 4 мишеней, охватывающих основные сайты мутаций мутантного штамма B.1.1.7 и южноафриканского мутантного штамма 501Y.V2.Этот набор может одновременно обнаруживать сайты мутаций N501Y, HV69-70del, E484K и новый ген S коронавируса;Быстрый тест: с момента взятия пробы до получения результата проходит всего 1 час 30 минут.

3

Рисунок 4. Кривая усиления британского варианта обнаружения COVID-19

4

Рисунок 5. Кривая амплификации южноафриканского варианта выявления COVID-19

5

Рисунок 6. Кривая амплификации нового коронавируса дикого типа.

Неясно, как эти мутации накапливают новые долгосрочные последствия пандемии COVID-19.Но это напоминает нам, что эти мутации могут повлиять на эффективность естественного иммунитета и иммунитета, вызванного вакцинацией.Это также напоминает нам о том, что нам необходимо постоянно отслеживать новый коронавирус в течение длительного времени и обновлять вакцину против COVID-19, чтобы справиться с эволюцией нового коронавируса.


Время публикации: 12 марта 2021 г.